(1) 系统与传统管理方法的矛盾
系统管理方法与传统管理方法的矛盾主要表现以下六个方面：
首先，决策和解决问题的时间基点和观念·时间哲学是面向过去还是着眼未来；是维持现状还是主动变化；是当机立断还是缓慢行动
其次，面临问题时思维方法的广狭性和深浅性。系统哲学是从全局出发还是从局部、本位出发；是个人主观判断还是以客观事实为出发点。对资源使用是大系统观有形与无形兼虚心还是局部观点考虑现实实用；是遵从目标管理还是一切屈从程序导向；是全局实现目标还是局部实现目标。
第三，分析、解决问题时对外部影响源选择的价值取向。权威哲学对待管理是科学与艺术结合还是凭经验办事无科学可言；是服从科学知识还是信服职位。
第四，传统管理方法过分强调管理工作专业化，容易造成工作重复、扯皮、管理间隙，片面性与本位主义；系统方法更强调人员和部门间的沟通、协调和综合。
第五，传统管理方法强调指挥、命令、控制和汇报，要有文件的传递形式子以保证；系统方法重视物质流与信息流维系一致与同步，信息要难确与及时。
第六，系统方法强调运用系统模型，力求达到量化，能够精确表达多因素实际行为和各要素之间的相互关系。
(2)现有管理体系与项目管理体系的矛盾。
(3)目标方面矛盾。
让各级领导和项目参与人员理解每个项目目标和管理目标，建立目标管理体系。
(4)组织方面的矛盾。
各级组织者存在多个目标，应准确定义并避免歧义，并给出重要性排序。
(5)管理方面矛盾。
主要是计划、组织、用人、领导和控制方面协调与平衡，在项目寿命周期的每个阶段，矛盾强度和排序不一。
(6资源冲突矛盾。
多个项目竞争有限资源和有限资源在分配顺序上的安排是矛盾焦点之一。
(7)项目近、短期目标与长远规划上矛盾．
每个项目穷于应付项目短、近期要求和忙于组织抢进度，使长远规划遭受损失易造成短期行为。
(8)人员培训发生矛盾。
项目频繁变换，开发人员经常在项目间转移，无暇培训。项目本身开发较忙、无力顾及培训，这些都影响了开发人员发展和提高业务水平。
(9)项目管理上授权、集权、分权上的矛盾。
(10)职能上的专业化管理与项目要求系统化管理之间的矛盾。
(11)项目经理与职能部门经理的矛盾。
(12)项目发展与专业发展的矛盾。
(13)项目开发人员受双重领导、指挥的矛盾。
(14)人才缺乏的矛盾与危机。
未来的项目负责人面临着项目竞争、项目开发与发展、项目管理的多重挑战、要求集战略、策划、人事、技术等技能于一身。项目经理业成为一门专业，项目经理应是一个“通才”，项目经理选择是关系项目成败的重要因素。培养合格项目开发专业人才与管理人才已刻不容缓。
(15)项目管理规范和制度建设与监督约束机制不健全的矛盾。
实行项目管理，需要制订一系列项目开发与管理规章制度，创造与其相配套的项目管理环境，开展项目管理上的基础建设同时，对项目规范与制度的执行和实施．一定要完善相应的监督机制与约束机制，逐步实现规范化、科学化项目管理。
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