转基因大豆之后，进口转基因玉米争议开始逐渐显露。6万吨、12万吨、54.5万吨、112万吨，半年时间内，被质检机关发现并做退运处理的违法转基因玉米数量快速增长。截止到4月21日，全国出入境检验检疫机构共对112.4万吨进口玉米及其制品进行了退运处理。在这些来自美国的玉米及其制品中均检出MIR162转基因成分，该类型转基因玉米在中国不允许销售。
连续退运
截止到4月21日，全国出入境检验检疫机构共对112.4万吨进口玉米及其制品进行了退运处理。在这些来自美国的玉米及其制品中均检出MIR162转基因成分，该类型转基因玉米在中国不允许销售。
4月29日下午，国家质检总局新闻办主任陈熙同，发布了质检总局关于质检部门检出美国MIR162转基因玉米最新进展情况，并表示对这些转基因玉米，口岸检验检疫机构均依法退运。
非法转基因玉米进口被发现以来，数量正在快速增长之中。2013年10月，深圳口岸从一批进口美国玉米中检出未经我国农业部批准的转基因成分后，天津、福建、山东、广东、浙江、厦门多个口岸相继检测出含有该成分的转基因玉米，所涉及数量直线上升。
2013年全年，中国共对60.1万吨进口转基因玉米及其产品采取了退运等措施，2014年头两个月退运的数量为28.6万吨，而头四个月退运数量接近去年全年总和。
美国全美谷物饲料协会表示，按照其统计，中国退运的转基因玉米数量超过125万吨。
农业部数据显示，2012年中国年净进口玉米495.0万吨，同比增长2.06倍，98.2%来自美国，主要是转基因玉米。
业内人士表示，连续大规模转基因玉米退运，一方面显示了对非法转基因产品进口监管的有效性，同时也显示了面对的压力和挑战。
“或许是有国内企业采购了这个品种的玉米，或许是其他品种中间掺杂了这个品种的玉米，不然不会连续性地退运，”山东一家粮食进口企业负责人在电话中表示，“进口转基因玉米对粮商来说利润并不是很大。”但其并未透露具体利润率。
锁定MIR162
在退运的转基因玉米中，集中在MIR162这一不被允许进入我国的品种上。
对于转基因玉米，相关部门态度明确，符合中国规定，取得批准的品种，并不阻止进口，但对未取得批准的品种，一律退运，MIR162品种从未获得过批准。
中国社科院农村发展研究所研究员李国祥告诉新金融记者，关于转基因产品进口，国家有着严格的监管体系。
农业部公布的《2012进口用作加工原料的农业转基因生物审批情况》显示，当年共有19个转基因农作物获准审批，可以进口。这其中8个产品为玉米品种，均为农业巨头孟山都、先锋国际、先正达等公司出产。分别为孟山都的抗虫玉米MON810、MON863、抗旱玉米MON87360;先锋国际的抗虫玉米TC1507、59122以及先正达的品质改良玉米3272、抗虫玉米Bt11、Bt176，允许进口时间均为3年。